Это длина строки без переносов – длина абзаца. Не знаю, во всей ли японской литературе так, или только в ранобе, но абзацы там обычно короче русских: бывает, что целыми страницами “одно предложение – один абзац” (хотя предложения могут быть длиннными). Кроме того, каждая реплика тоже считается за абзац.
Руби – да, это транскрипция, подписи над кандзи “как это слово читается”. Чем более простые слова подписаны, тем проще не знающим кандзи.